抗生物質のあとの腸、戻るが全部ではない

抗生物質を一通り飲んだあと、腸の群れは戻ってくるのか、そしてどれくらい待てばよいのか。よい問いですし、答えられる問いでもあります。いくつかの研究班が、サンプルをひとつずつ追いながらその様子を見てきました。彼らの数字は、よそで見かける不安あおりよりも、安心させる言葉よりも、ずっと面白いのです。

抗生物質の一コースが実際にすること

人でいちばんはっきりした絵は、2018年のNature Microbiologyに載ったPallejaらの研究です¹。健康な若い男性12人が、最後の切り札とされる抗生物質3種——メロペネム、ゲンタマイシン、バンコマイシン——を4日間まとめて使い、その後6か月にわたって便を提供しました¹。これは意図的に最悪の場合を作った設定です。のどの痛みでこの組み合わせを出される人はいません。

最初に起きたのは、空っぽになることではなく、並べ替えでした。腸内細菌科の菌をはじめとする病原共生菌が増え、その中にはEnterococcus faecalisとFusobacterium nucleatumがいました。いっぽうでBifidobacteriumの仲間と酪酸を作る菌は減りました¹。酪酸は、大腸の粘膜の細胞が燃料として燃やす短鎖脂肪酸です。ですから、それを作る菌を失うのは、見た目だけの変化ではありません。

しかも、速い。DethlefsenとRelmanが3人をシプロフロキサシンの2コースにわたって10か月追い、PNASに発表した研究では²、薬を始めて3〜4日のうちに多様性が下がり、群れの構成がずれました²。週ではなく、日の単位です。

測られた研究では回復にどれだけかかったか

以下のそれぞれの時間軸は、名前のついた研究に属するもので、どれもあなたへの約束ではありません。

コペンハーゲンの男性たちでは、群れは約1.5か月でベースラインに近い構成まで戻りました¹。これが希望のある半分です。もう半分は、治療前に12人全員が持っていた9種が、180日目の時点でも多くの人で検出できなかったということです¹。

DethlefsenとRelmanは、もっと細かい解像度で同じ形を見ています。シプロフロキサシンの各コースの約1週間後から、群れは出発点のほうへ戻りはじめましたが、その戻りはしばしば不完全で²、10か月の終わりには、それぞれの腸は、出発したときとは違う安定した構成に落ち着いていました²。

長い尾は、多くの人が思うよりも長く伸びます。Jernbergらは、クリンダマイシンを7日間使った4人と、治療していない4人を、2年のあいだに9回サンプリングして追いました³。彼らのBacteroides分離株のクローン多様性は崩れ、耐性クローンは残り、便のDNA中の耐性遺伝子は高いままで、Bacteroidesの群れ——Bacteroidota門の中の一属です——はその期間内に元の構成へ戻ることはありませんでした³。

大部分は数週間、細部は数か月、そして一部のメンバーについては、まだだれも見届けていないほど長く。

役に立つもの、証拠が支えないもの

ここでは、正直な答えは、解決策を売っている人を失望させます。

プロバイオティクスは、ひとつのことは上手にやり、もうひとつは下手です。上手なほうは下痢です。Guoらのコクランのレビューは、小児の無作為化試験33件、参加者にして合わせて6352人をまとめています⁵。抗生物質関連下痢はプロバイオティクスを飲んだ子どもの8 %に起き、対照群では19 %でした⁵。1例を防ぐのに9人、1日の量が50億CFU以上なら6人です⁵。証拠の確実性は中程度⁵。下痢の期間も1日近く短くしました⁵。これは本物です——そしてこれは症状についての結果であって、建て直しではありません。

だれにでも当てはまるわけでもありません。PLACIDE試験は、65歳以上の入院患者2981人を無作為化し、うち2941人を主要解析に含め、乳酸菌とビフィズス菌の多菌株製剤を1日6 × 10¹⁰個、21日間与えました。抗生物質関連下痢は製剤群で10.8 %、プラセボ群で10.4 %でした⁶。この集団では、利益はまったくありませんでした。

プロバイオティクスが下手なのは、建て直しそのものです。Suezらは2018年のCellで、便の先へ進み、抗生物質のあとの腸粘膜を内視鏡で採取しました⁴。ただ待つ場合と比べると、多菌株のプロバイオティクスは、その人自身のもともとの腸内フローラと腸の遺伝子発現の戻りを、はっきり遅らせ、しかも不完全なままにしました⁴。自家糞便移植——抗生物質の前に保存しておいた本人の便を、あとで戻すもの——は、数日で速やかに、ほぼ完全な回復をもたらしました⁴。培養皿の中では、乳酸菌が分泌する可溶性の因子が、戻ろうとする群れを押しとどめていました⁴。

食事については、いちばん強い信号はマウスのもので、私はそう明記しておきます。NgらはCell Host & Microbeで、食物繊維の足りない餌が崩れをひどくし、回復を遅らせること、そして単独で飼われた動物は一緒に飼われた動物よりずっと回復が悪いことを示しました⁷。マウスの生態は、あなたにとっては仮説であって、指示ではありません。とはいえそれは、食物繊維と酪酸を作る菌についてわかっているほかのすべてと同じ方向を指していますし、植物を食べることに危険はありません。

証拠が支えないもの。あなたの腸が回復する日付、群れを取り戻すことを測定された結果として示したサプリメント、あなたがもう終わったと告げてくれる市販の便検査。あのコクランのレビューの33件のうち、腸内フローラの特徴を報告したのは1件だけで、その1件は差を見つけませんでした⁵。

あなたの回復は研究の回復ではない

12人。3人。4人¹²³。これが上に挙げた人での標本の大きさで、この規模の生態は個人的なものです。DethlefsenとRelmanのデータでは、サンプル間の違いのいちばん大きな源は個人差でした²——薬よりも大きかったのです。

ですから、何が減り、何が増え、何が戻ってくるかは、あなたが持ち込んだ群れ、薬、コースの長さ、食べるもの、そしてまだだれも測っていないものに左右されます。同じ7日間を過ごしたふたりが、違う場所にたどり着くことがあるのです。

私ならここを持ち帰ります

処方されたコースは飲みきってください。ここまでの話のどれも、感染を中途半端に治療したままにする理由にはなりません。そのうえで、群れには日ではなく月の単位で時間を与え、戻ってきてほしいメンバーを養ってください——酪酸を作る菌には食物繊維を、マウスの証拠と原理の両方から⁷。下痢が問題なら、プロバイオティクスにはその問題についての証拠があります⁵。高齢の入院患者では弱くなりますが⁶。そして、もしだれかがあなたの腸内フローラを日程どおりに建て直すと言ってきたら、どの研究がそれを測ったのか聞いてください。いまのところ、それを測った研究は、建て直しが約束よりも遅く、不完全であることを見つけています。