Fusobacteriota

„Bakteria raka jelita grubego” jest normalna w ustach

Fusobacteriota to typ (cała gałąź drzewa bakterii) beztlenowych bakterii o wrzecionowatym kształcie. Normalnie żyją w jamie ustnej jako łącznik spajający płytkę nazębną: to rola budulcowa, nie usterka. Ale jeden mały klad Fusobacterium nucleatum jest silnie wzbogacony w guzach jelita grubego, gdzie jedna z jego adhezyn potrafi włączyć w ludzkich komórkach sygnały związane z nowotworem.

Czy to ma żyć w ustach? — kobieta wyciera ręce przy umywalce w łazience późną nocą
Typ
Fusobacteriota
Syn.
Fusobacteria
NCBI
txid32066

Poproś kogokolwiek, żeby wymienił bakterię żyjącą w jego ustach, a usłyszysz zwykle Streptococcus albo zobaczysz wzruszenie ramion. Prawie nikt nie mówi Fusobacterium. A przecież gdybyś dziś wieczorem zeskrobał płytkę nazębną z jednego zęba i włożył ją pod mikroskop, najpewniej patrzyłbyś właśnie na nie: długie, cienkie pałeczki, zwężone na obu końcach jak wrzeciono. Fusus to po łacinie wrzeciono. Na tym kończy się cała nazwa i być może jest to najuczciwsza rzecz, jaka o tej grupie padła, bo większość tego, co pisze o niej prasa, jest albo zbyt łaskawa, albo zbyt straszna.

Czym jest Fusobacteriota

Fusobacteriota to typ bakterii Gram-ujemnych, bezwzględnie beztlenowych, w większości o wrzecionowatym kształcie, których najlepiej znani ludzcy przedstawiciele należą do ustnego rodzaju Fusobacterium.

Typ to bardzo szeroka gałąź drzewa bakterii — piętro nad klasą, rzędem, rodziną i rodzajem. To więc nie jest jeden zarazek. To cała kończyna drzewa życia, a Fusobacterium nucleatum, gatunek, o którym pisze cała prasa, jest na niej pojedynczą gałązką. Zapamiętaj tę skalę; niemal każde nieporozumienie wokół tego organizmu bierze się z mylenia gałązki z konarem.

Ilustracja: bakteria o wrzecionowatym kształcie leży jak belka między skupiskami okrągłych komórek w rafie płytki nazębnej, oświetlona od dołu

Gdzie żyje w ciele

Przede wszystkim w jamie ustnej. Nie na samym języku i nie na samych zębach, lecz w całej architekturze: w płytce nazębnej, w kieszonce dziąsłowej, gdzie dziąsło styka się z zębem, w migdałkach, w gardle. Kiedy Dewhirst i współpracownicy budowali dla Journal of Bacteriology pierwszą opracowaną mapę mikrobioty jamy ustnej człowieka, skatalogowali 619 taksonów ustnych w trzynastu typach i osobno przeanalizowali 36 043 klony genu 16S rRNA, a Fusobacteria — bo tak wtedy zapisywano tę nazwę — były jednym z tych trzynastu 2.

Poniżej jamy ustnej obraz się zmienia. W dolnym odcinku jelita zdrowych ludzi Fusobacterium nucleatum opisuje się jako rzadkie 9. Owszem, pojawia się w jelicie, w łożysku, we krwi, w ropniach — ale jako podróżnik, nie jako mieszkaniec. To rozróżnienie, tutaj mieszkaniec, tam gość, okazuje się kluczem do całej tej historii.

Co robi dla nas

Dwie rzeczy, i chcę dokładnie powiedzieć, jak mocna jest każda z nich.

Spaja społeczność płytki nazębnej. Płytka nazębna nie jest byle mazią; składa się w określonej kolejności, najpierw pierwsi osadnicy, na końcu późne beztlenowce, a fizyczna odległość między komórkami różnych gatunków decyduje o tym, co w ogóle może rosnąć 3. Fusobacterium nucleatum siedzi w środku tej sekwencji i wiąże niezwykle szerokie grono partnerów — opisywano je jako tworzące biologiczne mosty, które stabilizują wielogatunkowy biofilm nazębny, a zdolność tę przypisuje się po części adhezynie wrażliwej na galaktozę, zwanej Fap2 11. Stabilna, uporządkowana społeczność to właśnie jest zdrowa jama ustna. Wyjmij łącznik, a nie dostaniesz czystszych ust; dostaniesz inne i mniej przewidywalne.

Wygląda też na to, że uruchamia własny antybiotyk dziąsła. W pracy opublikowanej w Infection and Immunity wyciąg ze ściany komórkowej F. nucleatum włączał ludzką beta-defensynę 2 — przeciwdrobnoustrojowy peptyd, który dziąsło wytwarza samo — w hodowanych komórkach nabłonka dziąsła w ciągu 2 do 4 godzin. Wyciąg ze ściany komórkowej patogenu przyzębia Porphyromonas gingivalis tego nie robił. Ta sama praca znalazła matrycowe RNA beta-defensyny 2 w 14 z 15 próbek dziąsła bez cech zapalenia 4. Sami autorzy odczytali to tak, że organizmy komensalne mają swój udział w utrzymaniu nienaruszonej bariery nabłonkowej.

Teraz zastrzeżenie, powiedziane na głos, bo waży więcej niż samo odkrycie: żadne z tych dwojga nie jest obietnicą zdrowotną. Nikt nie wykazał, że więcej Fusobacterium czyni usta zdrowszymi, i nikt nie sprzedaje go jako probiotyku — nie bez powodu. Dowody wspierają coś węższego i ciekawszego: ten organizm jest budulcową i sygnałową częścią normalnych ust, a nie najeźdźcą, który się wśliznął.

Ilustracja: okrągłe pierwsze osadniki tworzą warstwę na mineralnej powierzchni, w poprzek leżą długie wrzecionowate komórki, a wzdłuż nich przyczepiają się późniejsze komórki innych kształtów, składając się w jedną uporządkowaną społeczność

Co robi przeciwko nam

Ten sam organizm w niewłaściwym miejscu jest naprawdę groźny.

W jamie ustnej od dawna uznaje się go za uczestnika chorób przyzębia. Poza ustami przegląd w Current Opinion in Microbiology wylicza jego związki z powikłaniami ciąży, nieswoistymi zapaleniami jelit, zapaleniem wyrostka robaczkowego, chorobami układu krążenia, zakażeniami dróg oddechowych i zespołem Lemierre'a — zakażeniem gardła, które przenosi się na żyłę szyjną 10. U myszy szczep F. nucleatum z uszkodzonym genem fap2 kolonizował łożysko o 2 rzędy wielkości słabiej niż szczep normalny, co jest wskazówką, jak dociera tam, gdzie nigdy nie powinien 11.

Potem jest jelito grube. W 2012 roku dwie grupy opublikowały prace w tym samym numerze Genome Research, niezależnie od siebie i różnymi metodami. Castellarin i współpracownicy stwierdzili nadreprezentację Fusobacterium w tkance guza metodą sekwencjonowania RNA i potwierdzili to ilościowym PCR u 99 osób, przy p = 2,5 × 10⁻⁶ 5. Kostic i współpracownicy wyszli od pełnych sekwencji genomu 9 par guz–tkanka prawidłowa, potwierdzili wzbogacenie w 95 parach rak–tkanka prawidłowa i zobaczyli bakterie wewnątrz guzów w mikroskopie fluorescencyjnym 6. Kiedy dwa laboratoria dochodzą do tego samego miejsca z przeciwnych stron, wynik zwykle jest prawdziwy.

Rok później pojawił się mechanizm. Rubinstein i współpracownicy pokazali, że adhezyna FadA F. nucleatum wiąże E-kadherynę na ludzkich komórkach, uruchamia sygnalizację beta-kateniny i pobudza wzrost komórek raka jelita grubego. Miejsce wiązania na E-kadherynie mapuje się do odcinka 11 aminokwasów, a syntetyczny peptyd odwzorowujący ten odcinek znosił efekt. W tkance jelita grubego pacjentów z gruczolakami i gruczolakorakami poziom genu fadA był ponad 10 do 100 razy wyższy niż u osób zdrowych 7.

A w Science Bullman i współpracownicy stwierdzili, że bakteria nie zostaje w tyle: wędrowała razem z guzami do odległych przerzutów w wątrobie, przetrwała kolejne pasaże ludzkich guzów przez myszy, a leczenie tych myszy metronidazolem zmniejszyło ładunek bakteryjny, namnażanie komórek nowotworowych i wzrost guza w całości 8.

Ten ostatni wynik jest najczęściej przekręcany. To były myszy z przeszczepionymi ludzkimi guzami. To powód, by zrobić badanie kliniczne, a nie leczenie, na którym ktokolwiek miałby się opierać.

Nazwa — nowa i stara

Do niedawna ranga typu w ogóle nie podlegała kodeksowi nazewnictwa bakterii i dlatego podręczniki przez dziesięciolecia nosiły nazwy nieformalne. To się zmieniło: w 2021 roku Oren i Garrity opublikowali naraz formalne nazwy i opisy czterdziestu dwóch typów prokariotów 1. Fusobacteriota to nazwa obecna. Fusobacteria to pisownia starsza i pozostaje jej synonimem; NCBI Taxonomy wymienia obie przy tym samym wpisie, więc praca używająca któregokolwiek z tych słów mówi o tych samych organizmach.

Czego dowody nie mówią

Tu właśnie błądzi większość doniesień o tym typie.

W 2024 roku zespół publikujący w Nature zamknął 135 genomów F. nucleatum — 80 szczepów z ust osób bez nowotworu i 55 szczepów wyhodowanych z guzów u 51 chorych na raka jelita grubego. Znaleźli rozłam. Podgatunek animalis, długo traktowany jako jedna całość, to w rzeczywistości dwa klady i tylko jeden z nich dominuje w niszy guza. Ten sam wzorzec utrzymał się w tkance guza 116 chorych i w metagenomach kału 627 chorych na raka jelita grubego, zestawionych z 619 osobami zdrowymi 9.

Zdanie „Fusobacterium wywołuje raka jelita grubego” jest więc zbyt grube, żeby mogło być prawdziwe. Zdanie trafne jest dłuższe i mniej satysfakcjonujące: jedna podlinia, niosąca określone geny pozwalające przetrwać w jelicie, jest wzbogacona w guzach jelita grubego, prawdopodobnie przyczynia się do ich wzrostu i stanowi niewielki ułamek całego Fusobacterium, które większość ludzi nosi w ustach.

Nie ma na to testu dla konsumenta. Nie wykazano diety, która by to przesunęła. I nie ma dowodów, że mocniejszy atak na własną płytkę nazębną — ponad zwykłe szczotkowanie, nitkowanie i wizytę u dentysty — robi cokolwiek poza zaburzeniem społeczności, którą w zdrowych ustach ten typ pomaga spajać 3. Wniosek to nie strach przed bakterią. Wniosek jest taki, że to, gdzie drobnoustrój żyje, może znaczyć tyle samo co to, jakim jest drobnoustrojem.

Najważniejsze fakty

  • Nazwa typu Fusobacteriota została ważnie opublikowana w 2021 roku, w pracy, która naraz formalnie nazwała czterdzieści dwa typy prokariotów; starsza pisownia Fusobacteria jest jej synonimem.1
  • Fusobacteria były jednym z trzynastu typów w pierwszej opracowanej mapie mikrobioty jamy ustnej człowieka — bazie 619 taksonów ustnych, zbudowanej wraz z analizą 36 043 klonów genu 16S rRNA.2
  • Materiał ze ściany komórkowej Fusobacterium nucleatum włączał w komórkach nabłonka dziąsła przeciwdrobnoustrojowy peptyd — ludzką beta-defensynę 2 — w ciągu 2 do 4 godzin, a materiał patogenu Porphyromonas gingivalis nie.4
  • W tkance jelita grubego pacjentów z gruczolakami i gruczolakorakami poziom genu adhezyny fadA był ponad 10 do 100 razy wyższy niż u osób zdrowych.7
  • Wśród 135 zamkniętych genomów Fusobacterium nucleatum — 80 szczepów ustnych od osób bez nowotworu i 55 szczepów z guzów 51 chorych na raka jelita grubego — podgatunek animalis rozpadł się na dwa klady i tylko jeden z nich, Fna C2, zdominował niszę guza.9

Częste pytania

Czy Fusobacterium powinno być w moich ustach?

Tak. To normalny mieszkaniec płytki nazębnej i szczeliny, w której dziąsło styka się z zębem; był jednym z trzynastu typów skatalogowanych w pierwszej opracowanej mapie mikrobioty jamy ustnej człowieka [s2]. Znalezienie go to nie diagnoza.

Czy Fusobacterium wywołuje raka jelita grubego?

Uczciwa odpowiedź: związek jest silny, jeden mechanizm rozpracowano w komórkach, a przyczynowość u ludzi nie jest rozstrzygnięta. Dwie niezależne grupy genomowe znalazły go w 2012 roku wzbogaconego w tkance guza [s5][s6], a jego adhezyna FadA napędza w hodowanych komórkach sygnały związane z nowotworem [s7] — ale wzbogacenie w tkance nie dowodzi, że to on zapoczątkował guza.

To dlaczego nagłówki nazywają je bakterią raka?

Bo nagłówek jest grubszy niż dane. Sekwencjonowanie 135 szczepów pokazało, że wzbogacenie dotyczy jednego podkladu jednego podgatunku, a nie Fusobacterium jako całości [s9]. Większość Fusobacterium w większości ust nie należy do tego kladu.

Czy mam się go pozbyć mocną płukanką do ust?

Żadne badanie tego nie popiera i żadnego tu nie cytuję, bo nie umiałbym takiego wskazać. Fusobacterium jest budulcowym elementem normalnej płytki nazębnej [s3], a usuwanie normalnego członka społeczności nie jest sprawdzonym sposobem zapobiegania czemukolwiek. Zwykła kontrola płytki i dentysta pozostają drogą popartą dowodami.

Jak ten typ nazywał się wcześniej?

Fusobacteria. Ranga typu dopiero niedawno trafiła pod kodeks nazewnictwa bakterii, a formalna nazwa Fusobacteriota została ważnie opublikowana w 2021 roku [s1]. Obie nazwy wskazują te same organizmy.

Źródła

  1. Oren A., Garrity G. M., International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, 2021 — doi:10.1099/ijsem.0.005056
  2. Dewhirst F. E. et al., Journal of Bacteriology, 2010 — doi:10.1128/JB.00542-10
  3. Kolenbrander P. E. et al., Nature Reviews Microbiology, 2010 — doi:10.1038/nrmicro2381
  4. Krisanaprakornkit S. et al., Infection and Immunity, 2000 — doi:10.1128/IAI.68.5.2907-2915.2000
  5. Castellarin M. et al., Genome Research, 2012 — doi:10.1101/gr.126516.111
  6. Kostic A. D. et al., Genome Research, 2012 — doi:10.1101/gr.126573.111
  7. Rubinstein M. R. et al., Cell Host & Microbe, 2013 — doi:10.1016/j.chom.2013.07.012
  8. Bullman S. et al., Science, 2017 — doi:10.1126/science.aal5240
  9. Zepeda-Rivera M. et al., Nature, 2024 — doi:10.1038/s41586-024-07182-w
  10. Han Y. W., Current Opinion in Microbiology, 2015 — doi:10.1016/j.mib.2014.11.013
  11. Coppenhagen-Glazer S. et al., Infection and Immunity, 2015 — doi:10.1128/IAI.02838-14

Powiązane