Trois jours changent votre intestin. Puis tout revient

Vous avez croisé celle-ci dans un rayon de supermarché et dans une réclame de podcast : trois jours de jus, de bouillon ou de « protocole intestinal » en poudre, et votre microbiote repart de zéro. Page blanche. Nouveau vous. C'est l'une des rares promesses de santé qui arrive avec un chronomètre, ce qui la rend inhabituellement facile à vérifier — car les mesures existent, et elles font tourner l'horloge dans les deux sens.

Verdict : faux. Trois jours suffisent vraiment à déplacer une communauté intestinale — cette part de l'argumentaire est réelle. C'est très loin de suffire à la remettre à zéro, et c'est bien « remise à zéro » que l'on vous vend.

Ce que trois jours font vraiment

Commençons par la meilleure preuve que la promesse n'est pas une pure sottise. En 2014, David et ses collègues ont recruté onze volontaires ¹ — dix pour chacun des deux régimes extrêmes, neuf ayant fait les deux bras ¹ — un régime composé entièrement de produits animaux, un autre entièrement de végétaux, chacun suivi cinq jours d'affilée ¹. La communauté a bougé, et vite : des différences de composition étaient visibles un jour après qu'un colorant traceur eut montré que le régime animal avait atteint l'intestin ¹. Les organismes tolérants à la bile, dont Alistipes, Bilophila et les Bacteroides, ont monté sous le régime animal, tandis que les Firmicutes qui fermentent les polysaccharides végétaux — Roseburia, Eubacterium rectale, Ruminococcus bromii — reculaient ¹.

Wu et ses collègues avaient chronométré la même vitesse trois ans plus tôt. Dans une étude d'alimentation contrôlée chez dix sujets ², la composition changeait de façon détectable en 24 heures ² après un passage à une alimentation riche en graisses et pauvre en fibres, ou l'inverse.

Donc oui. Trois jours d'un vrai changement alimentaire se verront dans un échantillon de selles. Si « remise à zéro » veut dire « une lecture différente de celle de la semaine dernière », la promesse est vraie, et trivialement.

Et à quelle vitesse cela se défait

Maintenant l'autre sens, dans le même article. Le microbiote des sujets est revenu à sa structure d'origine deux jours après la fin du régime animal ¹. Deux jours. Le changement n'a pas survécu au régime qui l'avait causé, même d'une demi-semaine de travail.

L'équipe de Wu a testé la couche plus profonde et l'a trouvée solide. L'entérotype — la configuration large, Bacteroides contre Prevotella, dans laquelle une personne se range — est resté stable sur les 10 jours de l'étude ² alors que la composition bougeait d'un jour à l'autre en dessous. Ces entérotypes suivaient les habitudes alimentaires de longue date ² : les années de repas, pas la semaine.

La part qui ne bouge pas

La réponse la plus directe à « puis-je repartir de zéro » vient du comptage des souches plutôt que des espèces. Faith et ses collègues ont séquencé les selles de 37 adultes américains ³ sur des intervalles atteignant cinq ans ³ et trouvé qu'en moyenne 60 % des quelque 200 souches microbiennes de l'intestin d'un adulte étaient conservées sur cette fenêtre de cinq ans ³. En prolongeant la courbe de décroissance, ils ont conclu que la plupart des souches d'une personne y résident pendant des décennies ³.

C'est ce chiffre qui tranche ce mythe. Votre intestin n'est pas une ardoise. C'est un quartier à la population installée de longue date, et trois jours changent ce que font les habitants, pas qui ils sont.

À quoi ressemble une vraie perturbation

Si un protocole de jus ne peut pas remettre un intestin à zéro, qu'est-ce qui le peut ? Les antibiotiques sont la plus forte perturbation que l'on ait délibérément appliquée à des volontaires en bonne santé, et même eux n'atteignent pas le mot.

Palleja et ses collègues ont donné à 12 hommes en bonne santé ⁴ une cure de quatre jours ⁴ de trois antibiotiques de dernier recours — méropénème, gentamicine et vancomycine — et les ont suivis six mois ⁴. La communauté s'est effondrée, a proliféré en pathobiontes, puis s'est reconstruite : retour près de la composition de départ en 1,5 mois environ ⁴. Mais neuf espèces communes présentes chez chaque sujet auparavant restaient indétectables chez la plupart d'entre eux après 180 jours ⁴.

Dethlefsen et Relman avaient observé une version plus douce chez trois personnes sur dix mois ⁵, couvrant deux cures de ciprofloxacine. La diversité a chuté en trois à quatre jours après le début du médicament ⁵. Les communautés commençaient à revenir une semaine environ après la fin de chaque cure ⁵, mais le retour était souvent incomplet ⁵, et à la fin de l'étude l'intestin de chaque personne s'était stabilisé sur une composition différente de celle du départ ⁵.

Lisez ces deux-là ensemble et l'image n'est pas une remise à zéro. C'est une communauté qui résiste quand on la pousse, qui revient presque entièrement quand on la pousse fort, et qui garde une marque là où on l'a poussée le plus fort.

Pourquoi « remise à zéro » est le mauvais mot

Une remise à zéro suppose un état d'usine où revenir. Votre microbiote n'a pas d'état d'usine. Le seul point de référence qu'il possède est celui que vous assemblez depuis la naissance — et si votre intestin vous déplaît, ce point de référence est précisément ce que vous espériez quitter. Y revenir est ce qu'un protocole de trois jours fait de manière fiable ¹.

La version honnête de la promesse est plus étroite et plus utile que celle de l'étiquette. L'alimentation change vite la communauté intestinale, et la communauté garde le changement aussi longtemps que vous gardez l'alimentation. Ce n'est pas une déception, c'est le mécanisme. Les fibres nourrissent les fermenteurs, et les fermenteurs prolifèrent tant que les fibres continuent d'arriver. Arrêtez, et en deux jours environ vous êtes revenu au point de départ ¹.

Ce qu'il faut en retenir

Jugez la promesse à son horloge. Trois jours, c'est assez long pour changer une mesure et bien trop court pour changer une population. Rien dans la littérature ci-dessus ne dit qu'un protocole court est nocif, et rien n'y dit que l'effet survit au protocole. Si quelqu'un vous vend soixante-douze heures, demandez-lui ce qu'il attend de vrai à la soixante-treizième — et s'il l'a mesuré.

Trois jours, c'est une lecture sur un examen de laboratoire, pas une rénovation. La rénovation, c'est le quatrième mois passé à manger autrement, et personne ne vend cela en flacon.