Actinomycetota: кормит младенцев и вызывает туберкулёз

Представьте большую семью. Один родственник всю жизнь помогает новорождённым переваривать материнское молоко. Другой дал нам большую часть антибиотиков, которые стоят в аптеке. А третий вызывает болезнь, от которой в 2023 году умерло, по оценке ВОЗ, 1,25 миллиона человек ¹⁰. Это одна семья — тип бактерий Actinomycetota. Прежде чем решать, друг это или враг, давайте разберёмся, что такое «тип» и почему честный ответ — «и то и другое, смотря какой родственник».

Что это такое

Actinomycetota — это тип, одна из самых широких ветвей на дереве бактерий. Чтобы почувствовать ширину: человек и рыба относятся к одному типу — хордовым. Вот примерно такая родня.

Что их объединяет? Толстая клеточная стенка — микробиологи говорят «грамположительные», по имени датчанина Грама, который придумал окраску, — и необычный состав ДНК: в ней особенно много двух из четырёх «букв», гуанина и цитозина. Обзор Барки и соавторов в журнале Microbiology and Molecular Biology Reviews называет этот тип одним из самых больших среди бактерий: они есть в любой почве и в любой воде, а многие растут ветвящимися нитями и под микроскопом больше похожи на плесень, чем на микроба ². Отсюда и имя: «актино» — луч, «микес» — гриб.

Самое интересное — кто в этой семье. В обзоре Барки под одной крышей сидят кишечные жильцы (Bifidobacterium), почвенные (Streptomyces, Micromonospora), партнёры растений (Frankia) и возбудители болезней — Corynebacterium, Mycobacterium, Nocardia, Propionibacterium, Tropheryma ².

Два имени, одна группа

До недавнего времени группу звали Actinobacteria, и это слово вы увидите в большинстве статей, анализов и на этикетках пробиотиков. В 2021 году Международный комитет по систематике прокариот — тот, что заведует именами бактерий, — внёс ранг «тип» в официальный кодекс названий, и Орен с Гэррити опубликовали формальные имена для 42 типов, каждое привязанное к типовому роду ¹. Этот тип привязали к роду Actinomyces — отсюда Actinomycetota. База NCBI Taxonomy ведёт группу под этим именем, а Actinobacteria и Actinobacteriota числятся синонимами. В биологии ничего не изменилось. Если в исследовании написано Actinobacteria — речь ровно об этой группе. Не пугайтесь и не ищите разницу: её нет.

Где она живёт в вас

Кишечник. У взрослых Actinomycetota — один из четырёх главных типов кишечной микробиоты, и при этом, как пишут Бинда и соавторы в обзоре 2018 года, он «составляет лишь малую долю» сообщества, оставаясь «ключевым для поддержания равновесия в кишечнике» ³. Мало по численности — много по делу. Носитель этого дела — род Bifidobacterium, бифидобактерии.

У младенцев картина обратная. Кишечник ребёнка на грудном вскармливании часто заселён в основном бифидобактериями, и геном Bifidobacterium longum subsp. infantis, прочитанный Селой и соавторами в 2008 году, объясняет почему: в нём есть участок длиной 43 тысячи пар оснований — то есть «букв» ДНК — с набором генов, заточенных под сахара грудного молока, которые сам ребёнок переварить не может ⁴. Мама делает еду, которую её ребёнок не усваивает, — для бактерии, которая усваивает. Это не случайность природы, а способ пригласить нужного жильца.

Рот. База данных микробиома полости рта, собранная Девёрстом и соавторами, насчитывает 619 таксонов — видов и близких к виду групп — из 13 типов, среди них и Actinobacteria ⁸. Ротовой представитель семьи — Actinomyces; они, как отмечают Валур и соавторы, «в норме заселяют рот, пищеварительный и половой тракты человека» и никого не беспокоят ⁹.

Кожа. Обзор Грайс и Сегре в Nature Reviews Microbiology описывает заселение кожи как вопрос условий на каждом участке — жирный он, влажный или сухой — и отмечает, что большинство жильцов безвредны или даже полезны ⁶. Главный кожный житель этого типа — Cutibacterium acnes, прежнее имя Propionibacterium acnes. Дрено и соавторы пишут, что он «участвует в поддержании здоровой кожи» ⁷. Запомните это — пригодится ниже.

Что она делает для нас

Кормит защиту. Самое ясное доказательство механизма — работа Фукуды и соавторов в Nature, 2011 год ⁵. Мыши, заселённые определёнными штаммами бифидобактерий, пережили дозу кишечной палочки Escherichia coli O157:H7, которая в других условиях была смертельной ⁵. Защита свелась к генам одного переносчика углеводов и, как пишут авторы, «по крайней мере отчасти» к тому, что эти штаммы производили больше ацетата — уксусной кислоты; токсин палочки перестал проходить из кишечника в кровь ⁵. Простая кислота, сделанная бактерией из сахара, укрепила стенку кишечника. Оговорка вслух: это мыши, и защитные гены были не у всех штаммов. Какой штамм — важнее, чем какой тип.

Переваривает то, что вы не можете. Молочная машинерия B. infantis ⁴ — самый изученный пример того, как бактерия превращает неперевариваемую часть пищи в пользу для хозяина.

Делает лекарства — но не внутри вас. Примерно две трети природных антибиотиков, которые сегодня применяют в клинике, дал этот тип, в основном почвенные Streptomyces, плюс множество противоопухолевых, противоглистных и противогрибковых веществ ². Здесь надо быть честным: производители лекарств — не те бактерии, что живут в вашем кишечнике. Семья одна, район другой.

Может работать как пробиотик. В обзоре Бинды сказано, что бифидобактерии широко применяют как пробиотики и они показали «благоприятные эффекты при многих патологических состояниях», — и тут же, в том же предложении, добавлено: «нужны более крупные исследования на живом организме, чтобы подтвердить эти обнадёживающие результаты» ³. Эта оговорка и есть состояние науки на сегодня. Без неё честное предложение на эту тему не пишется.

Что она делает против нас

Туберкулёз. Mycobacterium tuberculosis — член этого типа. Сводка Корейского агентства по контролю заболеваний по докладу ВОЗ о туберкулёзе за 2024 год говорит прямо: в 2023 году заболели, по оценке, 10,8 миллиона человек, умерли 1,25 миллиона; носителем инфекции считается около четверти населения Земли; лечение занимает минимум 6 месяцев ¹⁰. Заметьте: четверть — это носительство, а не сама болезнь; сводка считает эти два числа отдельно. Самый известный член семьи — он же самый смертоносный.

Дифтерия, нокардиоз, болезнь Уиппла. Список возбудителей в обзоре Барки — Corynebacterium, Nocardia, Tropheryma — читается как глава учебника по инфекциям ².

Угри — но не так, как вы думаете. Тут самое неожиданное. Дрено и соавторы пишут: «размножение P. acnes не запускает акне, потому что у пациентов с акне в фолликулах не больше P. acnes, чем у здоровых людей». Болезнь, судя по данным, запускают потеря разнообразия кожных микробов вместе с активацией врождённого иммунитета ⁷. Бактерия живёт у всех; болезнь — не нашествие, а нарушенное равновесие. Поэтому «убить всех микробов на коже» — не план.

Актиномикоз. Те же Actinomyces, что тихо сидят во рту, редко, но могут вызвать хроническую инфекцию с гнойниками — обычно на лице и шее после больного зуба или в лёгких у курильщиков с плохим уходом за зубами. Обзор Валура называет стандартом лечения 6–12 месяцев пенициллина в высоких дозах, а профилактикой — уход за зубами ⁹. Сосед по умолчанию, возбудитель по случаю.

Оговорка, которая относится ко всему

Тип — очень грубая мерка. Проект «Микробиом человека» показал, что даже здоровые люди «заметно различаются» по микробам кишечника, кожи и других мест ¹¹. Строка в анализе кала «Actinobacteria: мало» или «много» смешивает в одно число бифидобактерии, Actinomyces и всё, что между ними, и нет доказательств, что двигать это число в какую-то сторону — цель для здоровья. Доказательства, которые есть, живут на уровне вида и штамма: конкретная бифидобактерия с конкретным набором генов у конкретного человека. Отсюда и надо начинать любое честное утверждение. А если в анализе написано «мало» — это не диагноз и не повод бежать за баночкой. Это повод спросить, кого именно посчитали.