Bacillota

Firmicutes는 살찌는 균이 아니다

Bacillota는 예전에 Firmicutes라 불리던 세균 문으로, 문 이름이 공식으로 정리된 2021년에 이름이 바뀌었습니다. 사람 대장을 지배하는 두 무리 가운데 하나이고, 장 점막을 먹이는 부티르산 생산균과 Clostridioides difficile 같은 병원균을 함께 품고 있습니다. 다만 널리 퍼진 'Firmicutes 대 Bacteroidetes 비율'은 믿을 만한 비만 지표가 아닙니다.

장내 세균이 살을 찌우나요? — 쉰 무렵의 여자가 해 질 녘 욕실 체중계 옆에 시큰둥하게 서 있다
Bacillota
Syn.
Firmicutes, low G+C Gram-positive bacteria, 후벽균문
NCBI
txid1239
Wikidata
Q25519942

대변 검사 결과를 막대그래프로 받아 본 적이 있다면, 가장 긴 막대에는 아마 Firmicutes라고 적혀 있었을 겁니다. 그 보고서는 당신이 "살찌도록 설계되어 있다"는 뜻이라고 말했을지도 모릅니다. 그 막대에 대해, 그리고 이제 새 이름을 쓰는 그 문에 대해 실제 연구가 무엇을 말하는지 여기 적어 둡니다.

Bacillota란 무엇인가

Bacillota는 세균의 문입니다. 세균 계통수의 최상위 가지이고, 동물에서 "척삭동물"이 앉는 것과 같은 계급입니다. 구성원 대부분은 한 겹의 두꺼운 세포벽을 지녀 그람양성으로 염색되고 — 그람음성으로 염색되는 Negativicutes가 늘 그러한 예외입니다 — 유전체에 DNA 글자 G와 C가 비교적 적습니다. 옛 교과서가 이들을 "저GC 그람양성균"이라 부르는 이유입니다.

이름은 새것입니다. 수십 년 동안 이 문은 "질긴 껍질"을 뜻하는 라틴어에서 온 Firmicutes였습니다. 2021년 1 국제원핵생물계통위원회가 문이라는 계급을 명명 규약 아래로 들였고, Oren과 Garrity가 각각 기준속 위에 세운 42개 문의 표준 이름을 유효하게 발표했습니다 1. Firmicutes는 기준속 Bacillus 위에 세운 새 이름 Bacillota가 되었습니다. 생물에 관해 달라진 것은 없고 이름표만 달라졌습니다. 소비자용 검사 거의 전부와 전환 이전에 쓰인 모든 논문에서 옛 이름을 여전히 만나게 되므로, 이 항목은 두 이름을 함께 씁니다.

일러스트: 벽이 두꺼운 막대 세균들이 먹이 삼는 전분 알갱이 위에 놓여 있고 그중 둘은 타원형 포자를 품고 있으며, 알갱이는 산호색으로 파여 있다

내 몸 어디에 사는가

주로 대장입니다. 스탠퍼드의 Eckburg 연구진이 2005년 2 건강한 성인의 대장 점막과 대변에서 리보솜 유전자 서열 13,355개 2 를 해독했을 때 두 지배 문은 Firmicutes와 Bacteroidetes였고, 서열 대부분은 누구도 실험실에서 키워 본 적 없는 종의 것이었습니다 2. 그 그림은 그대로 유지되었습니다. 여러 신체 부위에서 건강한 성인을 표집한 인간 마이크로바이옴 프로젝트는 건강한 사람들끼리도 어떤 미생물을 지니는지가 놀랄 만큼 다르며, 부위마다 서식지 특화가 뚜렷하다는 것을 찾아냈습니다 3. MetaHIT 카탈로그는 그 규모에 숫자를 붙였습니다. 유럽인 124명 4 의 대변에서 중복 없는 미생물 유전자 3.3백만 개 4, 사람 유전자 수의 약 150배 4, 그리고 한 사람도 빠짐없이 최소 160종 4 의 흔한 세균이었습니다.

Bacillota는 장에서 멈추지 않습니다. 이 문에 속하는 젖산간균은 Ravel 연구진이 증상 없는 여성 396명 8 의 질 미생물을 해독했을 때 찾아낸 다섯 군집 유형 가운데 넷 8 을 지배했습니다. 또 다른 구성원인 Staphylococcus aureus는 주로 코에 삽니다. The Lancet Infectious Diseases에 실린 Wertheim의 리뷰는 코를 이 균이 사람에서 차지하는 주된 생태적 자리라고 부릅니다 13.

우리에게 해주는 일

기전에서 시작합시다. 이점이 거기서 따라 나오기 때문입니다. 식이섬유와 저항성 전분은 소화되지 않은 채 대장에 닿습니다. 장내 세균이 그것을 발효해 짧은사슬지방산으로 만들고, 그중 둘인 부티르산과 프로피온산에 Louis와 Flint의 리뷰가 여러 건강 증진 기능을 돌립니다. 부티르산은 대장을 덮은 세포들이 가장 선호하는 연료입니다 5. 리뷰가 설명하는 주요 부티르산 생산균 — Faecalibacterium prausnitzii, Eubacterium rectale, Roseburia 무리 — 은 모두 Bacillota이고, 서로 먹여주기에 기대어 삽니다. 한 종의 젖산이나 숙신산이 다른 종의 원료가 됩니다 5.

그 생산균 가운데 가장 잘 연구된 것에는 자기 몫의 근거가 있습니다. Sokol 연구진은 수술로 장을 잘라낸 크론병 환자들을 추적해, 장 점막에서 F. prausnitzii의 몫이 적을수록 6개월 6 뒤 재발이 예측된다는 것을 찾아냈습니다. 실험실에서 이 세균은 사람 혈액세포가 IL‑12와 IFN-감마를 유의하게 덜 만들고 IL‑10을 더 만들게 했으며, 배양 상등액은 염증의 중심 스위치인 NF-카파B 활성화를 막았습니다 6. 단서는 소리 내어 말하겠습니다. 그 연구의 치료 부문은 사람이 아니라 화학적으로 대장염을 일으킨 생쥐였습니다. 그럴듯한 기전을 보여줄 뿐 입증된 치료법은 아닙니다.

생존 기술도 하나 있습니다. 생어 연구소의 Browne 연구진은 배양 불가로 여겨지던 건강한 사람 대변 속 137종 7 을 키워내는 데 성공했고, 그 유전체들은 장내 세균 속의 최소 50–60 % 7 가 질긴 포자를 만든다는 것을 시사했습니다. 그 포자 형성균 대부분이 Bacillota입니다. 포자는 산소를 싫어하는 장내 세균이 한 사람에게서 다음 사람에게로 옮겨 가는 여정을 견디게 해주고, 이 군집의 많은 부분이 애초에 공유되는 방식도 아마 그것일 것입니다 7.

일러스트: 벽이 두꺼운 막대균들이 저항성 전분 알갱이를 부숴 금빛 부티르산 방울로 만들고 대장 점막이 그것을 받아들이며, 열 개의 막대 가운데 여섯이 포자를 지니고 있다

우리를 상대로 하는 일

같은 문이 우리가 지닌 가장 심각한 병원균 몇을 품고 있습니다. Clostridioides difficile은 항생제가 경쟁자를 쓸어간 뒤 대장을 차지하는, 포자를 만드는 Bacillota 구성원입니다. 미국 10개 12 권역의 능동 감시에서 Lessa 연구진은 2011년 12 한 해에만 감염 453,000건 12 과 약 29,000명 12 의 사망을 추정했습니다. 사례의 65.8 % 12 가 의료 관련이었고, 65세 12 이상인 사람은 더 젊은 성인 대비 발생률비가 8.65 12 였습니다. Staphylococcus aureus는 또 하나의 일상적 예입니다. Wertheim의 리뷰는 코에 이 균을 지닌 사람이 자기 균주로 감염될 위험이 더 높고, 이 병원균의 항생제 내성이 높아지면서 세계 어디서나 치료가 까다로워지고 있다고 적습니다 13.

이 둘이 위에 나온 이로운 구성원들과 무엇을 공유하는지 보십시오. 포자, 두꺼운 벽, 끈질김입니다. Bacillota를 든든한 동맹으로 만드는 바로 그 형질이 이 문의 병원균을 쫓아내기 어렵게도 만듭니다.

비만 비율, 정직하게

이제 막대그래프 이야기입니다. 2006년 9 Ley와 Turnbaugh, Klein, Gordon은 비만한 자원자 12명 9 이 마른 사람보다 Bacteroidetes 비중이 낮았고, 두 9 가지 저열량 식단으로 체중을 줄이는 동안 그 비중이 올라갔다고 Nature에 보고했습니다. 함께 실린 생쥐 연구는 "비만" 미생물상이 음식에서 더 많은 에너지를 뽑아내며 그 형질이 무균 생쥐로 옮겨간다는 것을 찾아냈습니다 10. 그 논문들에서 Firmicutes/Bacteroidetes 비율이 뚱뚱함과 날씬함을 가리키는 눈금으로 대중문화에 들어왔습니다.

그 뒤의 근거는 협조하지 않았습니다. Magne 연구진이 2020년 11 문헌을 검토해 보니 연구들 사이의 결과가 서로 어긋났고, 그 차이는 체중만큼이나 검체 취급과 시퀀싱 방법, 제대로 기술되지 않은 생활 습관으로도 쉽게 설명되었습니다. 저자들 자신의 표현으로 된 결론은 이렇습니다. 현재로서는 이 비율을 특정 건강 상태와 연결 짓기 어렵고, 더욱이 비만의 표지로 보기는 어렵다 11. 그러니 검사 보고서의 긴 Bacillota 막대는 진단이 아닙니다. 그것은 대장 점막이 돌아가는 연료를 만드는 부티르산 생산균과 병원이 걱정하는 병원균을 함께 품은 한 문의 스냅숏이고, 그 막대는 당신이 둘 중 무엇을 지녔는지 말해주지 못합니다.

핵심 사실

  • Bacillota는 예전에 Firmicutes라 불리던 문의 유효한 이름이며, 이 이름은 다른 41개 문 이름과 함께 2021년에 유효하게 발표되었습니다.1
  • 사람 대장과 대변을 처음으로 크게 시퀀싱한 조사(리보솜 유전자 서열 13,355개)에서 Firmicutes와 Bacteroidetes가 두 지배 문이었고, 서열 대부분은 실험실에서 한 번도 배양된 적 없는 종의 것이었습니다.2
  • MetaHIT 카탈로그는 유럽인 124명의 대변에서 중복 없는 미생물 유전자 3.3백만 개를 찾았습니다. 사람 유전자 수의 약 150배이며, 한 사람마다 최소 160종의 흔한 세균을 지니고 있었습니다.4
  • 장 점막 건강과 가장 많이 엮이는 짧은사슬지방산인 부티르산과 프로피온산은 우리가 소화하지 못하는 식이섬유를 발효하는 장내 세균이 주로 만들며, 주요 부티르산 생산균은 Bacillota에 속합니다.5
  • Bacillota의 주요 구성원인 Faecalibacterium prausnitzii는 사람 혈액세포에서 염증성 IL‑12와 IFN-감마를 낮추고 IL‑10을 높였으며, 이 균이 줄어든 것이 수술 6개월 뒤 크론병 재발을 예측했습니다.6
  • 건강한 장에 사는 세균 속의 최소 50–60 %가 사람 사이를 옮겨 다니도록 만들어진 질긴 포자를 만듭니다. 이 연구는 '배양 불가'로 불리던 장내 137종을 분리해냈습니다.7
  • Bacillota의 구성원인 Clostridioides difficile은 2011년 한 해 미국에서 감염 453,000건과 약 29,000명의 사망을 일으킨 것으로 추정됩니다.12
  • 2020년 Firmicutes/Bacteroidetes 비율 리뷰는 발표된 결과들이 서로 어긋나 현재로서는 이 비율을 특정 건강 상태와, 더욱이 비만의 표지와 연결 짓기 어렵다고 결론지었습니다.11

자주 묻는 질문

Bacillota와 Firmicutes는 같은 것인가요?

네. Firmicutes는 같은 문의 더 오래된 이름입니다. 국제원핵생물계통위원회가 문이라는 계급을 명명 규약 아래로 들이기로 의결한 뒤 2021년에 Oren과 Garrity가 42개 문의 표준 이름을 유효하게 발표했고, Firmicutes는 Bacillota가 되었습니다. 옛 논문과 소비자용 검사 보고서 대부분은 지금도 Firmicutes라고 적습니다. 생물이 달라진 것이 아니라 이름표만 달라졌습니다.

Firmicutes 대 Bacteroidetes 비율이 높으면 살이 찌고 있다는 뜻인가요?

이 생각은 비만인 12명이 체중을 줄이면서 Bacteroidetes 비중이 올라갔다는 2006년 Nature 연구에서 나왔습니다. 2020년에 문헌을 검토한 리뷰는 연구들 사이의 결과가 서로 어긋난다고 보고했고, 현재로서는 이 비율을 특정 건강 상태와 연결 짓기 어려우며 비만의 표지로 보기는 더더욱 어렵다고 결론지었습니다. 검사 보고서에 찍힌 비율 하나가 알려주는 것은 매우 적습니다.

Bacillota 세균은 저에게 좋은가요, 나쁜가요?

구성원에 따라 둘 다입니다. 이 문에는 대장 점막을 먹이는 주요 부티르산 생산균과 건강한 질 미생물을 지배하는 젖산간균이 들어 있고, Clostridioides difficile과 Staphylococcus aureus도 들어 있습니다. 문 전체를 두고 좋다 나쁘다 판단하는 것은 '포유류'가 좋은지 나쁜지 따지는 것과 같습니다.

Bacillota는 제 몸 어디에 사나요?

주로 대장입니다. 그곳에서 두 지배 문 가운데 하나입니다. 이 문에 속하는 젖산간균은 대부분 여성의 질 미생물을 지배하고, 또 다른 구성원인 Staphylococcus aureus는 주로 코에 삽니다.

식단으로 '좋은' Bacillota를 늘릴 수 있나요?

주요 부티르산 생산균은 소화되지 않은 채 대장에 닿는 식이섬유와 저항성 전분을 먹고 자라며, 서로의 부산물을 주고받으며 먹습니다. Louis와 Flint의 리뷰가 펼쳐 놓은 기전이 그것입니다. 내 수치가 얼마나 움직일지는 사람마다 다르고, 이 페이지의 어떤 검사도 그것을 예측하지 못합니다.

출처

  1. Oren A, Garrity GM. Valid publication of the names of forty-two phyla of prokaryotes. Int J Syst Evol Microbiol, 2021 — doi:10.1099/ijsem.0.005056
  2. Eckburg PB et al. Diversity of the human intestinal microbial flora. Science, 2005 — doi:10.1126/science.1110591
  3. Human Microbiome Project Consortium. Structure, function and diversity of the healthy human microbiome. Nature, 2012 — doi:10.1038/nature11234
  4. Qin J et al. A human gut microbial gene catalogue established by metagenomic sequencing. Nature, 2010 — doi:10.1038/nature08821
  5. Louis P, Flint HJ. Formation of propionate and butyrate by the human colonic microbiota. Environ Microbiol, 2017 — doi:10.1111/1462-2920.13589
  6. Sokol H et al. Faecalibacterium prausnitzii is an anti-inflammatory commensal bacterium identified by gut microbiota analysis of Crohn disease patients. PNAS, 2008 — doi:10.1073/pnas.0804812105
  7. Browne HP et al. Culturing of 'unculturable' human microbiota reveals novel taxa and extensive sporulation. Nature, 2016 — doi:10.1038/nature17645
  8. Ravel J et al. Vaginal microbiome of reproductive-age women. PNAS, 2011 — doi:10.1073/pnas.1002611107
  9. Ley RE, Turnbaugh PJ, Klein S, Gordon JI. Microbial ecology: human gut microbes associated with obesity. Nature, 2006 — doi:10.1038/4441022a
  10. Turnbaugh PJ et al. An obesity-associated gut microbiome with increased capacity for energy harvest. Nature, 2006 — doi:10.1038/nature05414
  11. Magne F et al. The Firmicutes/Bacteroidetes ratio: a relevant marker of gut dysbiosis in obese patients? Nutrients, 2020 — doi:10.3390/nu12051474
  12. Lessa FC et al. Burden of Clostridium difficile infection in the United States. N Engl J Med, 2015 — doi:10.1056/NEJMoa1408913
  13. Wertheim HFL et al. The role of nasal carriage in Staphylococcus aureus infections. Lancet Infect Dis, 2005 — doi:10.1016/S1473-3099(05)70295-4

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