Bacillota

Firmicutes, heute Bacillota: keine Dickmacher-Bakterien

Bacillota ist das Bakterien-Phylum, das früher Firmicutes hieß und 2021 umbenannt wurde, als die Namen der Phyla formal vereinheitlicht wurden. Es ist eine der beiden vorherrschenden Gruppen im menschlichen Dickdarm und enthält sowohl die Butyratbildner, die die Darmschleimhaut ernähren, als auch Krankheitserreger wie Clostridioides difficile; das beliebte „Verhältnis von Firmicutes zu Bacteroidetes“ ist allerdings kein verlässliches Zeichen für Übergewicht.

Machen Darmbakterien dick? — eine Frau um die fünfzig steht in der Dämmerung unbeeindruckt neben der Badezimmerwaage
Stamm
Bacillota
Syn.
Firmicutes, low G+C Gram-positive bacteria
NCBI
txid1239
Wikidata
Q25519942

Wenn Sie je einen Stuhlbefund mit einem Balkendiagramm zurückbekommen haben, war der größte Balken wahrscheinlich mit Firmicutes beschriftet. Vielleicht stand dabei, das heiße, Sie seien „auf Gewichtszunahme gebaut“. Hier steht, was die Studien wirklich über diesen Balken sagen — und über das Phylum, das jetzt einen neuen Namen trägt.

Was Bacillota ist

Bacillota ist ein Phylum von Bakterien: ein oberster Ast am Stammbaum der Bakterien, derselbe Rang, auf dem bei den Tieren die Chordatiere stehen. Die meisten Mitglieder haben eine dicke, einschichtige Zellwand — sie färben sich grampositiv; die Negativicutes, die sich gramnegativ färben, sind die stehende Ausnahme — und ein Erbgut, das vergleichsweise arm an den DNA-Buchstaben G und C ist, weshalb ältere Lehrbücher sie „G+C-arme Grampositive“ nennen.

Der Name ist neu. Jahrzehntelang hieß das Phylum Firmicutes, nach dem lateinischen Wort für „zähe Haut“. 2021 1 stellte das Internationale Komitee für die Systematik der Prokaryoten den Rang des Phylums unter seinen Namenscode, und Oren und Garrity veröffentlichten gültig einheitliche Namen für 42 Phyla 1, jeden auf eine Typusgattung gebaut. Aus Firmicutes wurde Bacillota, gebaut auf die Typusgattung Bacillus. An den Organismen änderte sich nichts, nur am Etikett. Auf fast jedem Verbrauchertest und in jeder Arbeit von vor der Umstellung werden Sie dem alten Namen weiterhin begegnen, deshalb führt dieser Eintrag beide.

Illustration: dickwandige Stäbchenbakterien, zwei davon mit ovalen Sporen, liegen auf einem Stärkekorn, das dort korallrot angefressen ist, wo sie fressen

Wo es in Ihnen lebt

Vor allem im Dickdarm. Als Eckburg und Kollegen in Stanford im Jahr 2005 2 insgesamt 13.355 2 Sequenzen ribosomaler Gene aus Darmschleimhaut und Stuhl gesunder Erwachsener entzifferten, waren die beiden vorherrschenden Phyla die Firmicutes und die Bacteroidetes, und die meisten Sequenzen gehörten zu Arten, die nie jemand im Labor gezüchtet hatte 2. Dieses Bild hat gehalten. Das Human Microbiome Project, das gesunde Erwachsene an vielen Körperstellen untersuchte, fand, dass selbst gesunde Menschen sich bemerkenswert darin unterscheiden, welche Mikroben sie tragen, mit starker Spezialisierung von einer Stelle zur nächsten 3. Der MetaHIT-Katalog legte Zahlen an den Maßstab: 3,3 Millionen 4 nicht redundante mikrobielle Gene im Stuhl von 124 4 Europäern, rund das 150-Fache 4 der menschlichen Genzahl, und mindestens 160 4 häufige Bakterienarten in jedem einzelnen Menschen.

Bacillota hören nicht am Darm auf. Laktobazillen, die zu diesem Phylum gehören, beherrschten vier der fünf 8 Gemeinschaftstypen, die Ravel und Kollegen fanden, als sie das Scheidenmikrobiom von 396 8 beschwerdefreien Frauen entzifferten. Und Staphylococcus aureus, ein weiteres Mitglied, lebt vor allem in der Nase: Wertheims Übersicht in The Lancet Infectious Diseases nennt die Nase seine wichtigste ökologische Nische beim Menschen 13.

Was es für uns tut

Beginnen wir mit dem Mechanismus, denn der Nutzen folgt aus ihm. Ballaststoffe und resistente Stärke erreichen den Dickdarm unverdaut. Darmbakterien vergären sie zu kurzkettigen Fettsäuren, und zwei davon, Butyrat und Propionat, sind jene, denen die Übersicht von Louis und Flint eine Reihe gesundheitsfördernder Aufgaben zuschreibt, wobei Butyrat der bevorzugte Brennstoff der Zellen ist, die den Dickdarm auskleiden 5. Die wichtigsten Butyratbildner, die sie beschreiben — Faecalibacterium prausnitzii, Eubacterium rectale und die Roseburia-Gruppe —, sind alle Bacillota, und sie leben von gegenseitiger Fütterung: Das Laktat oder Succinat der einen Art wird zum Rohstoff der nächsten 5.

Der am besten untersuchte dieser Bildner hat eigene Belege. Sokol und Kollegen verfolgten Menschen mit Morbus Crohn nach einer Darmoperation und fanden, dass ein geringerer Anteil von F. prausnitzii auf der Darmschleimhaut einen Rückfall 6 Monate 6 später vorhersagte. Im Labor ließ das Bakterium menschliche Blutzellen deutlich weniger IL‑12 und IFN-gamma und mehr IL‑10 bilden, und sein Kulturüberstand blockierte die Aktivierung von NF-kappaB, einem zentralen Schalter der Entzündung 6. Der Vorbehalt, laut ausgesprochen: Der Behandlungsarm dieser Studie bestand aus Mäusen mit chemisch ausgelöster Dickdarmentzündung, nicht aus Menschen. Er zeigt einen plausiblen Mechanismus, keine belegte Therapie.

Dazu kommt ein Überlebenstrick. Browne und Kollegen am Sanger Institute gelang es, 137 7 Arten aus dem Stuhl gesunder Menschen zu züchten, die längst als nicht kultivierbar abgeschrieben waren, und ihre Genome legten nahe, dass mindestens 50–60 % 7 der Bakteriengattungen im Darm widerstandsfähige Sporen bilden. Die meisten dieser Sporenbildner sind Bacillota. Sporen erlauben es sauerstoffscheuen Darmbakterien, den Weg von einem Menschen zum nächsten zu überstehen, und so wird ein großer Teil dieser Gemeinschaft vermutlich überhaupt erst weitergegeben 7.

Illustration: dickwandige Stäbchen zerlegen ein Korn resistenter Stärke in goldene Butyrattröpfchen, die die Dickdarmschleimhaut aufnimmt; sechs der zehn Stäbchen tragen eine Spore

Was es gegen uns tut

Dasselbe Phylum beherbergt einige der schwersten Krankheitserreger, die wir tragen. Clostridioides difficile ist ein sporenbildendes Mitglied der Bacillota, das den Dickdarm übernimmt, nachdem Antibiotika seine Konkurrenz beseitigt haben. In einer laufenden Überwachung in 10 12 Regionen der Vereinigten Staaten schätzten Lessa und Kollegen 453.000 12 Infektionen und etwa 29.000 12 Todesfälle allein im Jahr 2011 12; 65,8 % 12 der Fälle standen mit der Gesundheitsversorgung in Verbindung, und Menschen ab 65 12 Jahren hatten gegenüber jüngeren Erwachsenen ein Ratenverhältnis von 8,65 12. Staphylococcus aureus ist das andere alltägliche Beispiel: Wertheims Übersicht hält fest, dass Träger in der Nase ein höheres Risiko haben, später an ihrem eigenen Stamm zu erkranken, und dass die zunehmende Antibiotikaresistenz des Erregers die Behandlung weltweit erschwert 13.

Beachten Sie, was diese beiden mit den hilfreichen Mitgliedern von oben teilen: die Spore, die dicke Wand, die Beharrlichkeit. Dieselben Eigenschaften, die Bacillota zu widerstandsfähigen Verbündeten machen, machen ihre Krankheitserreger schwer wieder loszuwerden.

Das Verhältnis zum Übergewicht, ehrlich betrachtet

Nun zum Balkendiagramm. 2006 9 berichteten Ley, Turnbaugh, Klein und Gordon in Nature, dass 12 9 fettleibige Freiwillige einen geringeren Anteil an Bacteroidetes trugen als schlanke Menschen und dass dieser Anteil stieg, während sie mit zwei 9 kalorienarmen Kostformen abnahmen. Die begleitende Mäusestudie fand, dass ein „fettleibiges“ Mikrobiom mehr Energie aus der Nahrung zog und dass sich diese Eigenschaft auf keimfreie Mäuse übertragen ließ 10. Aus diesen Arbeiten wanderte das Verhältnis von Firmicutes zu Bacteroidetes als Regler zwischen dick und dünn in die Populärkultur.

Die Belege seither haben nicht mitgespielt. Magne und Kollegen sichteten 2020 11 die Literatur und fanden die Ergebnisse der Studien widersprüchlich, wobei sich die Unterschiede ebenso leicht mit der Behandlung der Proben, der Sequenziermethode und schlecht beschriebenen Lebensumständen erklären ließen wie mit dem Körpergewicht. Ihr Schluss, in ihren eigenen Worten: Es ist derzeit schwierig, das Verhältnis mit einem bestimmten Gesundheitszustand zu verbinden, und erst recht, es als Kennzeichen von Fettleibigkeit anzusehen 11. Ein hoher Bacillota-Balken in einem Befund ist also keine Diagnose. Er ist die Momentaufnahme eines Phylums, das sowohl die Butyratbildner enthält, von denen Ihre Dickdarmschleimhaut lebt, als auch die Erreger, die Ihrem Krankenhaus Sorgen machen — und der Balken kann Ihnen nicht sagen, welche davon Sie tragen.

Fakten auf einen Blick

  • Bacillota ist der gültige Name für das Phylum, das früher Firmicutes hieß; der Name wurde 2021 zusammen mit 41 weiteren Namen von Phyla gültig veröffentlicht.1
  • In der ersten großen Sequenzierung von menschlichem Dickdarm und Stuhl (13.355 Sequenzen ribosomaler Gene) waren die Firmicutes und die Bacteroidetes die beiden vorherrschenden Phyla, und die meisten Sequenzen gehörten zu Arten, die nie im Labor gezüchtet worden waren.2
  • Der MetaHIT-Katalog fand im Stuhl von 124 Europäern 3,3 Millionen nicht redundante mikrobielle Gene, rund das 150-Fache der menschlichen Genzahl, wobei jeder Mensch mindestens 160 häufige Bakterienarten trug.4
  • Butyrat und Propionat, die kurzkettigen Fettsäuren mit dem engsten Bezug zur Gesundheit der Darmschleimhaut, entstehen vor allem, wenn Darmbakterien Ballaststoffe vergären, die wir selbst nicht verdauen können; die wichtigsten Butyratbildner gehören zu den Bacillota.5
  • Faecalibacterium prausnitzii, ein bedeutendes Mitglied der Bacillota, senkte in menschlichen Blutzellen das entzündungsfördernde IL‑12 und IFN-gamma und hob IL‑10 an; sein Verlust sagte einen Rückfall bei Morbus Crohn 6 Monate nach der Operation voraus.6
  • Mindestens 50–60 % der Bakteriengattungen in einem gesunden Darm bilden widerstandsfähige Sporen, gebaut für den Weg von Mensch zu Mensch; die Studie züchtete 137 Darmarten an, die als nicht kultivierbar galten.7
  • Clostridioides difficile, ein Mitglied der Bacillota, verursachte in den Vereinigten Staaten im Jahr 2011 schätzungsweise 453.000 Infektionen und etwa 29.000 Todesfälle.12
  • Eine Übersicht zum Verhältnis von Firmicutes zu Bacteroidetes kam 2020 zu dem Schluss, dass die widersprüchlichen veröffentlichten Ergebnisse es derzeit schwer machen, das Verhältnis mit einem bestimmten Gesundheitszustand zu verbinden und es erst recht als Kennzeichen von Fettleibigkeit anzusehen.11

Häufige Fragen

Ist Bacillota dasselbe wie Firmicutes?

Ja. Firmicutes ist der ältere Name für dasselbe Phylum. 2021, nachdem das Internationale Komitee für die Systematik der Prokaryoten beschlossen hatte, den Rang des Phylums unter den Namenscode zu stellen, veröffentlichten Oren und Garrity gültig einheitliche Namen für 42 Phyla, und aus Firmicutes wurde Bacillota. Ältere Arbeiten und die meisten Testberichte für Verbraucher schreiben weiterhin Firmicutes; die Organismen haben sich nicht geändert, nur das Etikett.

Ist ein hohes Verhältnis von Firmicutes zu Bacteroidetes ein Zeichen dafür, dass ich zunehme?

Der Gedanke stammt aus einer Nature-Studie von 2006 an 12 fettleibigen Menschen, deren Anteil an Bacteroidetes stieg, während sie abnahmen. Eine Übersicht der Literatur von 2020 fand die Ergebnisse der Studien widersprüchlich und kam zu dem Schluss, dass es derzeit schwierig ist, das Verhältnis mit einem bestimmten Gesundheitszustand zu verbinden, geschweige denn es als Kennzeichen von Fettleibigkeit zu behandeln. Ein einzelnes Verhältnis in einem Befund sagt sehr wenig.

Sind Bacillota-Bakterien gut oder schlecht für mich?

Beides, je nach Mitglied. Das Phylum enthält die wichtigsten Butyratbildner, die die Dickdarmschleimhaut ernähren, die Laktobazillen, die ein gesundes Scheidenmikrobiom beherrschen, und ebenso Clostridioides difficile und Staphylococcus aureus. Ein ganzes Phylum zu beurteilen ist, als wollte man „Säugetiere“ als gut oder schlecht einstufen.

Wo in meinem Körper leben Bacillota?

Vor allem im Dickdarm, wo sie eines der beiden vorherrschenden Phyla sind. Laktobazillen, die zu diesem Phylum gehören, beherrschen das Scheidenmikrobiom der meisten Frauen, und Staphylococcus aureus, ein weiteres Mitglied, lebt vor allem in der Nase.

Kann ich meine „guten“ Bacillota über die Ernährung stärken?

Die wichtigsten Butyratbildner wachsen auf Ballaststoffen und resistenter Stärke, die unverdaut im Dickdarm ankommen, und sie füttern einander mit ihren Nebenprodukten. Das ist der Mechanismus, den die Übersicht von Louis und Flint darlegt. Wie stark sich Ihre eigenen Werte bewegen, ist individuell, und kein Test auf dieser Seite kann es vorhersagen.

Quellen

  1. Oren A, Garrity GM. Valid publication of the names of forty-two phyla of prokaryotes. Int J Syst Evol Microbiol, 2021 — doi:10.1099/ijsem.0.005056
  2. Eckburg PB et al. Diversity of the human intestinal microbial flora. Science, 2005 — doi:10.1126/science.1110591
  3. Human Microbiome Project Consortium. Structure, function and diversity of the healthy human microbiome. Nature, 2012 — doi:10.1038/nature11234
  4. Qin J et al. A human gut microbial gene catalogue established by metagenomic sequencing. Nature, 2010 — doi:10.1038/nature08821
  5. Louis P, Flint HJ. Formation of propionate and butyrate by the human colonic microbiota. Environ Microbiol, 2017 — doi:10.1111/1462-2920.13589
  6. Sokol H et al. Faecalibacterium prausnitzii is an anti-inflammatory commensal bacterium identified by gut microbiota analysis of Crohn disease patients. PNAS, 2008 — doi:10.1073/pnas.0804812105
  7. Browne HP et al. Culturing of 'unculturable' human microbiota reveals novel taxa and extensive sporulation. Nature, 2016 — doi:10.1038/nature17645
  8. Ravel J et al. Vaginal microbiome of reproductive-age women. PNAS, 2011 — doi:10.1073/pnas.1002611107
  9. Ley RE, Turnbaugh PJ, Klein S, Gordon JI. Microbial ecology: human gut microbes associated with obesity. Nature, 2006 — doi:10.1038/4441022a
  10. Turnbaugh PJ et al. An obesity-associated gut microbiome with increased capacity for energy harvest. Nature, 2006 — doi:10.1038/nature05414
  11. Magne F et al. The Firmicutes/Bacteroidetes ratio: a relevant marker of gut dysbiosis in obese patients? Nutrients, 2020 — doi:10.3390/nu12051474
  12. Lessa FC et al. Burden of Clostridium difficile infection in the United States. N Engl J Med, 2015 — doi:10.1056/NEJMoa1408913
  13. Wertheim HFL et al. The role of nasal carriage in Staphylococcus aureus infections. Lancet Infect Dis, 2005 — doi:10.1016/S1473-3099(05)70295-4

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